スカウトミッションとは、これまでにロック解除された地域に点在するバトルです。オレンジのスカウトマーカーの一つをタップして、スカウトをそこへ派遣すると、彼らは様々なバトルや宝物を見つけてくれます。バトルの種類はプレイヤーのレベルによって決まります。村にあるスカウトのスリングショットをタップすることで、スカウトが発見できるものを確認することができます。